隨著她的孫子玄燁登極繼位，孝莊從皇太後變成了太皇太後。

史學家普遍認同，孝莊在順治朝和康熙朝頗有作為，但她最大的曆史貢獻是培養出了一個康熙大帝。

康熙幼年患天花被遷出宮外生活，但凡飲食、語言、讀書、生活習慣，都在祖母孝莊的督促下養成。孝莊愛讀書的習慣，感染了康熙，使他自小就保持著“早夜讀誦，無間寒暑”的良好作風。孝莊亦時時要求年幼的康熙要做一個勤政愛民的好皇帝。

有一次，她當著眾人問小康熙：“身為天下之主有何打算？”

康熙朗聲回答：“臣無他欲，惟願天下乂安，民生樂業，共享太平之福而已。”

康熙日後成長為頗有作為的皇帝，離不開孝莊的教導和培養。正如後來康熙自己所說，“設無祖母太皇太後，斷不能有今日成立”。

不過，日漸長大的康熙要“成立”，首先必須攀過輔政大臣尤其是鼇拜這座山峰。

順治駕崩後，有個江南的秀才進京上書，請孝莊垂簾聽政。但孝莊並無此意，終其一生，她隻是在緊要關頭以太後身份適度參與政治，她並不願走到前台臨朝聽政。原因當然是多方麵的，包括滿洲祖宗之法的限製、漢族社會對所謂牝雞司晨現象的非議等等，但孝莊愛惜羽毛，唯恐陷入聲名之爭也是重要的一個原因。

因此，孝莊和親王們為康熙設置了四個輔政大臣。鑒於多爾袞擅權的教訓，此次四個輔政大臣沒有一個宗室，誰也不具備爭奪皇權的威望和資格。此外，四人的思想傾向也經過孝莊的檢驗，確保他們與孝莊的保守政治傾向保持一致。這樣，康熙繼位之初，在四輔臣的操持下，朝廷盡廢順治在位時的漢化措施，恢複滿族製度。

但是，隨著時間推移，四輔臣中的鼇拜強勢崛起，淩駕於其他輔臣之上，儼然成了第二個多爾袞。這讓孝莊變得焦灼——相同的政治傾向，並不能阻止權臣的誕生。