任務期間，乘組共進行了4次出艙活動和7次載荷進出艙任務，完成空間碎片防護裝置安裝、艙外輔助裝置安裝、艙外設施設備巡檢等任務。其中，在艙外平台安裝的腳限適配器和接口轉接件有效提高了航天員艙外作業效率，問天實驗艙此前規劃的空間碎片防護裝置也已全部完成安裝。

原定11月5日返回的神舟二十號載人飛船疑似遭空間微小碎片撞擊，推遲歸期。等待回家的神舟二十號航天員乘組利用這段時光，與神舟二十一號航天員乘組共同開展在軌科學實驗和試驗。為神舟二十一號乘組多交流一些經驗、多添一組數據、多留一串屬於中國的星辰足跡。