由於探索三號為破冰船，具有艏艉1.2米的雙向破冰能力，作業水域由敞水水域擴展到極區水域。“探索三號”船設置了6米×4.8米的大開口尺寸月池，可在浮冰及惡劣海況下進行科考作業，提升了高海況下科考作業的適應性。

另外，探索三號的國產化率從關鍵核心裝備的國產化擴展到船載關鍵核心控製係統的國產化，包括動力控製、動力定位控製係統及機艙和駕駛台綜合控製係統的國產化，實現關鍵核心技術的自主可控。

針對未來數智化的發展趨勢，探索三號研究並獲得4個智能船舶入級符號，為船舶數字化和智能化的發展進行了有益的探索。